雖然，轉基因食品便宜，但在各大超市，非轉基因食品是最受消費者青睞的，而非轉基因也被商家當做一個大優勢大肆宣傳。雖然轉基因大豆油對人體是否有害還存在爭議，但大多數人購買大豆油時還是習慣性的選擇價格更好的非轉基因大豆油。那麼轉基因大豆油的危害到底在哪裏呢？
最初轉基因大豆的研製是爲了消滅雜草。有一種除草劑草甘膦在除草的過程中能除掉很多種雜草，不過也會殺害作物。而通過轉基因的方法，就讓大豆產生更多能抵抗甘草膦的EPSPS合成酶，從而提高大豆的產量也降低生產成本。雖然說在提煉大豆油的工程中大部分EPSPS合成酶的蛋白質和DNA被消除，但人們人擔心是否有些微量元素混雜在油脂中，從而被人攝入，從而影響人的安全。具體體現在：
1、大豆可能會被施以過多的草甘膦除草劑，這些除草劑可能隨大豆油進入人體，而轉基因大豆的EPSPS合成酶比普通的大豆多，而過多的EPSPS合成酶進入人體，可能會影響人類的健康。
2、影響人類的基因。轉基因大豆中所轉的基因片斷混入人體，從而對人體本身的基因造成影響。
3、營養被破壞。科學家們認爲外來基因會以一種人們目前還不甚瞭解的方式破壞食物中的營養成分。
4、所轉基因可能會有人類所不知的功能，與植物合成一些對人類健康有害的物質，並隨大豆油進入人體造成影響。
5、對抗生素產生抵抗。當科學家把一個外來基因加入到植物或細菌中去，這個基因會與別的基因連接在一起。人們在服用了這種改良食物後，食物會在人體內將抗藥性基因傳給致病的細菌，使人體產生抗藥性。
