轉基因大豆油，利用生物技術改變的食物原有的性質、營養和品質等，而且它是否安全目前還沒有定論，所以人們在購買大豆油的時候寧願花更高的價格購買非轉基因大豆油。非轉基因大豆油不僅安全，常吃好處多多。
相對於轉基因大豆油來說，非轉基因大豆油含有更高的不飽和脂肪酸，更容易被人體吸收消化。此外，它含有對人體健康有益的亞麻酸、亞油酸和豐富的維生素E等多種營養成分，其中，亞油酸是人體必需的脂肪酸，扮演着人體清道夫的角色，清除人體內的“垃圾”，而且亞油酸不能由人體自身合成，需要從食用油裏攝取，所以常吃大豆油能強身健體，還可以幫助人們滋潤皮膚。
非轉基因大豆油中還含有棕櫚酸7-10%，硬脂酸2-5%，花生酸1-3%，油酸22-30%，亞油酸50-60，亞麻油酸5-9%。它的脂肪酸構成比例好 ，可以降低血清中的膽固醇含量，有預防心血管疾病的功效。
