我們都知道食用油主要成分是甘油三脂，而轉基因大豆所轉移的基因的作用就是讓植物產生更多EPSPS酶，和植物油脂的成分沒有關係，在加工豆油的過程中轉基因成分大部分已經被去掉了，不過，人們對食用轉基因大豆油的擔憂在於是否有些微量混雜在油脂中，進而被人攝入，從而影響人的安全，它的危害可能體現在以下幾個方面：
1、影響人類的基因。轉基因大豆中所轉的基因片斷混入人體，從而對人體本身的基因造成影響。
2、轉基因大豆的EPSPS合成酶比普通的大豆多，而過多的EPSPS合成酶進入人體，可能會影響人類的健康。
3、所轉基因可能會有人類所不知的功能，與植物合成一些對人類健康有害的物質，並隨大豆油進入人體造成影響。
4、大豆可能會被施以過多的草甘膦除草劑，這些除草劑可能隨大豆油進入人體，影響人體的健康。
5、營養被破壞。科學家們認爲外來基因會以一種人們目前還不甚瞭解的方式破壞食物中的營養成分。
6、對抗生素產生抵抗。當科學家把一個外來基因加入到植物或細菌中去，這個基因會與別的基因連接在一起。人們在服用了這種改良食物後，食物會在人體內將抗藥性基因傳給致病的細菌，使人體產生抗藥性。
從營養安全的角度講，目前還沒有發現轉基因食品不利於人體健康的證據，也沒有出現因此引發的食品安全糾紛，所以這些危害會否成真還需要時間驗證。如果消費者擔心自己的身體健康，可以選擇“非轉基因食品”。
