對於大多數單純的眼皮跳躍的人來說，最常見的原因是眼睛過度或疲勞，精神過度緊張，如電腦時間過長強光或弱光下眼睛過長、考試前精神壓力過大等。另外，眼睛屈光不正、近視、遠視或散光，眼內異物、倒睫、結膜炎、角膜炎等也會引起眼瞼跳躍。
人的眼瞼有兩種肌肉，一種叫做眼輪肌，形狀像車輪，環繞眼睛，收縮時眼瞼閉合，這種眼輪肌被臉神經支配。另一種眼瞼肌肉被稱爲提高眼瞼肌肉，收縮後眼瞼開放，這種肌肉被眼神經所支配。在眼瞼的這兩種肌肉組織中，眼輪肌對保護眼球有重要作用，通過不斷閉合潤滑和清洗角膜，對外部刺激發出保護性反應。
引起眼瞼跳躍的疾病，病理性眼瞼跳躍的原因很多。常見的包括：倒睫、結膜炎、角膜炎、眼外傷、腦炎、腦血管疾病等；不太常見的包括：貝爾麻痹（單純性周圍面神經麻痹）、肌肉張力障礙、痙攣性斜頸、多發性抽動症等， 甚至有部分患者是與遺傳因素有關。
此外，腦腫瘤和動脈硬化可能刺激面部神經，引起眼部和麪部激烈反應。因此，從某種意義上講，眼皮跳躍也是人體健康和心理狀況的警報器，特別是長期眼皮跳躍必須警惕腦內是否有病變。
很多人只限於上眼瞼和下眼瞼的跳躍，但也有發展爲上下眼瞼的持續抽動的人。支配眼瞼肌肉的面部神經在傳導通道的任何部位都會受到刺激，眼瞼的跳躍、神經受到刺激的部位不同，眼瞼的跳躍部位、跳躍範圍和程度也不同。
刺激因素僅限於支配眼輪肌的神經末梢，即眼瞼附近，表現出的症狀是單純的上眼瞼和下眼瞼跳躍。受刺激的部位在腦腔內的臉神經幹部的話，跳躍範圍會牽累上下眼瞼整體，最直觀的表現是不由得眨眼，醫學上被稱爲眼瞼痙攣。
如果眼皮持續跳躍，沒有消失的意思，請注意。這種類型的眼皮跳躍多爲病理性，可能是額頭、頭內或全身性疾病的臨牀症狀，屬於許多身體症狀之一。眼果眼瞼跳躍不能自行緩解，甚至持續惡化，導致同一側面部顫抖或抽動，應及時就醫，並告知醫生相應的情況以便進一步診斷和治療。
