通常來說，益生菌粉如果服用劑量及方式不合理，可能使得胃腸道功能紊亂的人羣進一步出現腹瀉、腹脹等症狀，嚴重時可能會引發腸炎。
益生菌主要包括雙歧桿菌、乳酸菌、酵母菌等，而益生菌粉通常是使用以上菌種製作而成，常規使用一般能夠調節腸道，可以避免便祕、消化不良等情況。但是，如果不規範使用益生菌粉，可能會使體質較差的人羣出現胃腸道不適，導致胃腸功能紊亂，從而出現腹瀉、腹痛等症狀。隨着症狀不斷加重，患者可能會出現腸炎。另外，對於體質敏感的人羣，攝入不規範的益生菌粉，還可能會誘發過敏。建議平時出現不適症狀後，立即前往醫院進行治療。
另外，日常建議不要食用辛辣刺激性食物，例如辣椒、生薑等，以免出現上火。
