引起腎積水的原因有先天性因素，包括肌肉發育不全、輸尿管狹窄、輸尿管高位開口，也有可能是後天性因素引起的，比如膀胱輸尿管迴流、輸尿管或腎盂腫瘤息肉。
一、引起腎積水的先天性因素
1.肌肉發育不全：如果腎盂輸尿管交界處或者是上段的輸尿管，出現了階段性肌肉發育不全等情況，那麼這一段的輸尿管正常蠕動就會受到影響，從而產生動力性梗阻。如果這種病變是發生在輸尿管膀胱入口處，可能會形成先天性巨輸尿管，進而導致腎積水，還有腎臟、輸尿管擴張的情況。
2.輸尿管狹窄：如果存在輸尿管狹窄的情況，也容易導致腎積水。這種情況大多發生在腎盂和輸尿管交界處，狹窄部位的長度通常是在1~2毫米之間，這樣容易產生不完全梗阻和繼發性扭曲。長了肌肉細胞會被破壞，從而形成以膠原纖維爲主的無彈性狹窄段，對尿液的傳送造成阻礙，最終形成腎積水。
3.輸尿管高位開口：輸尿管高位開口是導致腎積水比較常見的先天性因素之一，這種情況有可能是腎盂周圍纖維化，或者是膀胱輸尿管迴流引起。
二、引起腎積水的後天性因素
1.膀胱輸尿管迴流：如果某些原因導致了膀胱輸尿管迴流，容易造成輸尿管扭曲的現象，再加上輸尿管周圍發生了纖維化，很容易形成腎盂輸尿管交界處或輸尿管梗阻的情況，此時可能會引發腎積水。
2.輸尿管或腎盂腫瘤息肉：如果患有輸尿管或腎盂部位的腫瘤性疾病或者是吸入性疾病，也容易導致輸尿管出現梗阻現象，時間長了會發生腎積水。
