山藥豆最好不要存放在冷凍室。山藥豆和山藥一樣，儲藏方法以低溫乾燥、陰涼處最佳，冷凍也可以，但是對功效有一點影響。另外，山藥豆不宜冰凍過長時間，日常可以存放在溫度10攝氏度以下的環境中。
如果是已經煮熟了的山藥豆，吃不完的話大家可以選擇存放在冷藏室短暫保存。如果是生的山藥豆，最好不要放入冷凍室，溫度過低以及冷藏時間太長都會影響其營養價值，不利於人們的健康。
像山藥豆這種食物，最好是新鮮購買並趁新鮮食用，這樣纔不會影響其本身的食療功效。注意，放在常溫下保存的話，不要用塑料袋盛裝，那樣透氣性不好；也不要用報紙來包裹鐵棍山藥，報紙上的鉛會深入山藥內部對健康不利；可以用餐巾紙包裹後放在通風陰涼乾燥處存放。
