儘管黑小米具有有利人體的成分，但是食用或搭配不當同樣會造成對人體的危害，黑小米的禁忌搭配有哪些呢？
首先儘管黑小米是豐富的蛋白質來源，含有大量人體必需氨基酸如色氨酸、亮氨酸、精氨酸等，但是它卻缺少人體另外一種氨基酸一一賴氨酸，單獨的黑小米粥的營養不全面。所以黑小米最好是與大豆或者肉類食物搭配食用來起到補充賴氨酸的作用，避免造成人體中賴氨酸的缺乏。有一點也要特別注意，黑小米一定要煮熟煮透才能食用，不然一些營養物質無法轉化爲人體能吸收的成分，反而造成食用後不易消化甚至反胃嘔吐。
再者黑小米補脾養胃、滋養腎氣、補虛損、清虛熱、安眠等功效。而杏仁確實作爲主治風寒肺病，清熱解毒的藥物來用。兩者不能搭配在一起食用，否者會導致食用者嘔吐、噁心，有厭惡之感。
在北方許多婦女的產後，都會將紅糖黑小米當做保養恢復的優良食物，有着“代蔘湯”的美稱。具有的滋陰養血，對產婦虛寒的體質保養恢復，協助她們康復膂力大有裨益。而現代人由於長期處於壓力中食慾也較差，使用黑小米則可以起到助消化和養腸胃的功效。
