做腸鏡時，因爲是一根細管從肛門進入腸道，這種機械性的操作很多人擔心會不會有什麼副作用，或者說給患者造成二次損傷。那麼做腸鏡有沒有副作用呢？
一般來說，腸鏡檢查過程中，患者因爲長管的伸入和過程中的充氣操作會讓患者產生一些不適的感覺。而且有很多患者因爲過於緊張，整個過程都無法放鬆自己，這種緊張的狀態可能會讓自己感覺疼痛，而且還會影響醫生的檢查。除此之外，腸鏡是沒有什麼副作用的，也沒有什麼危險。但是如果是做需要打麻藥的無痛腸鏡，那麼就可能會因爲麻醉的關係出現一些麻醉意外或者是出血、過敏的情況但是這種情況出現的機率很小。
另外就是做腸鏡的過程中需要充氣，所以在做完之後腸部還會有氣體殘餘，這可能會使被檢查的患者在檢查之後感覺到腹脹，但這種情況在幾個小時後就可以消失，做完腸鏡後對腹部進行一下順時針的按摩可以幫助體內積聚的空氣排出。因此做腸鏡是沒有什麼副作用，也不會給患者造成二次傷害的。
