腸易激綜合徵可應用解痙藥或者止瀉藥進行治療，便祕型腸易激綜合徵可適當應用促動力劑或通便劑來治療，如果伴有明顯心理症狀，可應用抗抑鬱藥治療。
1、解痙藥或止瀉藥
如果腸易激綜合徵主要症狀是腹瀉，可適當應用解痙藥或止瀉藥來進行治療。解痙藥包括選擇性胃腸平滑肌鈣離子通道阻滯劑和離子通道調節劑。
2、促動力劑或通便劑
如果是腹脹和便祕型腸易激綜合徵，可適當應用促動力劑進行治療，促進腸胃蠕動，促進排氣及改善便祕。如果便祕比較嚴重，可適當應用通便劑進行治療。
3、抗抑鬱藥
部分腸易激綜合徵是由於精神因素導致，往往會伴隨抑鬱等心理症狀。這種情況下可以應用抗抑鬱藥進行治療，比較常用的就是選擇性5羥色胺再攝取抑制劑。
