皮膚扁平苔蘚可能會復發。
治療皮膚扁平苔蘚多採用西醫激素、消炎、維生素等簡單的施治方法，往往是治病治表。皮膚扁平苔蘚的症狀下去以後，患者需要長期服用藥物，達到控制病情的目的。這樣做雖然起到了短期康復的效果，卻有可能會導致復發。
自身免疫問題導致的疾病的兩大特點一般是易復發、頑固難治。除了扁平苔蘚之外，口腔潰瘍、白塞氏病等均有這樣一個特點。患者有時感覺自己的扁平苔蘚沒有症狀了，以爲是自愈了；也有患者服用簡單的藥物施治之後，身體上的症狀就消失不見了，以爲是因爲吃藥的效果，讓身體恢復了健康，其實不然，這主要是因爲自身免疫系統異常引起的假象。部分治療手段具有侷限性，患者需要到專業正規的醫院，使用專業的方法幫助重整自身免疫系統異常的問題。
