性交射精時出現疼痛可能是平時縱慾過度、過於勞累所致等生理因素引起的，也可能是炎症感染、結石疾病、腫瘤疾病、其它疾病等病理性疾病引起的。
1.縱慾過度：如果在平時縱慾過度，性生活次數過多，或者頻繁手淫，就可能會導致陰囊或會陰部內有痠痛不適感，進而也就會在射精時疼痛發作。
2.過於勞累：若長期從事較重體力活，或參加比較劇烈的體育活動，而沒有在充足休息的情況下發生性生活，就也容易伴隨有射精疼痛的反應。
1.炎症感染：導致射精疼痛的主要疾病就是生殖器官炎症。如果患有附睾炎、精囊炎或者精阜炎等炎症性疾病，射精時陰莖部位肌肉會發生節律性收縮，從而引起性交射精疼痛等不適感，嚴重時還會導致疼痛性遺精。同時也有可能是前列腺炎所致，與尿道炎症也有關係。
2.結石疾病：尿結石發病率較高，若小的結石卡在後尿道，特別是射精管的開口部位，就會導致局部軟組織收縮蠕動，擠壓到結石時便可出現疼痛感。另外，還有可能是膀胱結石或輸尿管結石所致。
3.腫瘤疾病：生殖系統腫瘤可引發明顯的射精疼痛感，性能力可能會直線下降。這時要着重檢查附睾、前列腺和精囊等多個部位是否長出了腫瘤，並要及時做病理學檢查確定腫瘤的良惡性。
4.其它疾病：除了上述疾病之外，若存在有尿道狹窄和陰莖硬結症、精索靜脈曲張，以及嚴重的包皮過長等疾病，也可成爲性交射精時疼痛的誘發因素，故要儘快到醫院接受檢查和診斷。
