1、容易被感染：水下分娩最大的缺點就是容易被感染，因爲分娩時會從母體流出很多的血液、分泌物等，會使水很容易受污染，這樣就很容易帶給產婦和嬰兒致命的危險，所以一般需要及時不斷地換上乾淨的水！
2、費用比較高：由於水下分娩需要使用分娩池、消毒措施、無菌系統、水質、溫度管理等，所以費用比較貴！
3、比較難監測胎兒的心跳情況，新生兒發生呼吸問題比較多！
4、要求醫院必須採用專業的水下分娩設備，而且醫護人員需要經過專業的操作培訓。如果操作不規範，很容易發生意外！
