牙周基礎治療的目的是消除病因，控制炎症，也有人稱此階段爲病因治療。包括自我控制菌斑、正確有效的刷牙、牙齦清潔術(刷牙)、牙齦清潔術、根面平整術、咬合調整消除咬合性損傷、鬆動牙齒的牙周夾板固定、拔除無保留價值的患牙等。
治療時，我們主要採用超聲波設備法，主要通過超聲波頭振動場所刺激物，二是手工設備法，通過專用設備去除刺激物。北京306醫院口腔科湯楚華
部分患者認爲牙周治療週期長，就診次數多，時間緊迫多次不願就診，寄希望於單純的藥物治療，這種觀念是錯誤的。對於牙周炎，藥物只能起到輔助作用，徹底去除菌斑和牙石是最重要的。
