膀胱乙狀結腸瘻在治療上根據乙狀結腸膀胱瘻患者的不同階段進行不同的治療:
第一階段(瘻發生後7~10天)
患者在瘻口尚未穩定期和感染初期，腹腔內感染嚴重，局部炎症浮腫，手術修補腸瘻口失敗，感染擴散的患者應禁食，胃腸減壓，給予胃腸外營養糾正的一般情況
第二階段（10～30日）
經過第一階段處理，患者逐漸恢復，瘻口經過引流或處理已成爲“被控制”的瘻，感染仍很嚴重或繼續發展擴散時應積極控制感染加強營養。特別是全靜脈營養是供給熱量和氮源的必要手段。
第三階段(1~3月)
經1~2階段處理，效果好的口癒合或穩定，腸瘻低對營養影響小，但口癒合不好時，應立即瞭解不癒合因素，常見原因:
①口遠端梗塞。
②瘻管組織已皮化。
③結腸粘膜與腹壁癒合，使瘻口呈脣狀。
④嘴裏有異物。
⑤瘻口附近有膿腫引流不暢。
⑥有特殊感染或腫瘤。
此期間，重點是尋找口腔不癒合的原因，控制腹腔內感染，特別是腸壁間隙膿腫，高度懷疑時必須立即剖腹探索引流膿腫。當然，b型超聲波檢查證明，在其引導下行穿刺流膿，注入抗生素，手術中腹腔廣泛粘連，容易損傷腸管。
第四階段
腸瘻未癒合的患者，腹腔感染控制，瘻口局部情況好，可考慮擇期手術，清除病因，以關閉瘻口。瘻口遠端梗阻應解除後修修補瘻口的單純脣狀瘻或管狀瘻，可以將瘻口轉向腸腔，不要過度檢查腹腔。當然，當局部特殊感染或腫瘤存在時，病變應切除。
