治療尖銳溼疣的藥物很多，包括注射藥、內服藥和外用藥。患者在選擇治療尖銳溼疣的藥物時，可能會選擇一些治療病毒效果不明顯、只能抑制病毒、不能殺死病毒的藥物。它們不僅錯過了治療時間，而且效果不大，有時會產生負面影響。
因此，在醫生的指導下使用藥物是選擇藥物的關鍵。防止尖銳溼疣復發的常用藥物有口服抗病毒藥物。廣譜抗病毒藥物，如利巴韋林，不宜使用口服抗病毒藥物殺滅皰疹病毒，因爲價格昂貴，療效差。
中醫在增強人體免疫方面起着非常獨特的作用，在治療西醫無法治療的病毒性疾病方面往往起着意想不到的作用，包括對等SAAS病人的治療也起到了一定的輔助治療作用。中藥治療包括口服中藥辨證治療、中藥外洗和坐浴。
醫術較高的中醫大夫可以根據患者的體症，開一些適合該患者的中藥製劑，能夠起到增強免疫的作用，對抑制尖銳溼疣復發會有一定的效果;其它中藥如膚陰潔，在治療前或治療後有皮炎出現時，外用清洗或溼敷，特別是患溼疣的妊娠婦女，用之則有明顯的輔助治療作用。以下是一些針對女性尖銳溼疣的藥物:
1，5%5%-Fu軟膏5-Fu是一種常用的抗腫瘤藥物，能抑制細胞增殖，力量溫和，一般需要治療2~3周。
2.醋酸:三氯醋酸是一種強酸，可用於燒疣，一般用於治療Ⅱ型病變。塗抹前，將棉球2%的卡因塗抹在病變局部3-5分鐘後，將病變塗抹在棉籤上50%的三氯乙酸，使藥液達到基底；塗抹時注意不要傷害周圍健康的粘膜組織，月經期間不要使用；每週服藥兩次。或外用20%柳酸冰醋酸。3.鬼臼毒素酊:對小尖銳溼疣有很好的效果。咪喹莫特：對尖銳溼疣的治療和預防有作用。尖銳溼疣不僅會影響個人健康和伴侶健康，還會危及下一代。若未完全治癒，殘留病毒無法清除，反覆發作！因此，積極治療必須採用科學的方法。忌諱疾忌醫。
