因為新生兒便祕是單獨的疾病，也許只是某種疾病的症狀，所以應該區分便祕的原因和哪種型別的便祕很重要。
便祕的治療需要全面理解便祕的程度，多長時間才能更好地初步判斷是什麼原因引起的便祕，哪種型別的便祕，這需要全面的檢查來明確診斷。
1、詳細瞭解病史和體檢:是選擇便祕過程的重要基礎。對於大多數便祕患者，儘量採用無創方法，判斷便祕型別，根據經驗治療效果，驗證臨床推斷。
2、便祕型別:是選擇治療方法的重要依據。無論是經驗治療還是進一步檢查後的治療，都強調針對不同的便祕型別，採取相應的治療措施。
3、強調確定便祕型別的重要性:提出有警報徵兆的便祕患者，強調病因調查，強調難治性便祕缺乏警報徵兆，確定便祕型別的重要性。
4、接受各種檢查手段的比例:對於很多便祕，以經驗治療為主，難治性便祕應進一步檢查，少數患者特別是需要外科手術的患者，需要進一步深入檢查。
5、瞭解便祕特徵作出便祕型別：如對經驗治療療效不佳者，進一步檢查以瞭解病因和型別，而一開始經檢查後未發現器質性性病變時，可回到瞭解便祕特徵作出便祕型別，或進一步進行有關便祕型別的檢查後進行治療等。
