胃食管反流爲良性病變，生存期不會受到影響，可患者與正常人一樣可保持正常壽命。但是該病危害性不容小覷，可導致胃腸道出血、食道潰瘍、食道狹窄等病症。
1、胃腸道出血
胃腸道出血主要表現爲：嘔血、便血，常合併缺鐵性貧血，發生機率爲30%~35%左右。出血多來源於食道炎。
2、食道潰瘍
胃食管反流誘發食道潰瘍，發病率在2%~37%左右。當食道內柱狀上皮受到胃酸影響會發生潰瘍，類似於胃潰瘍等症狀。食道潰瘍以疼痛爲主要表現，疼痛可放射至背部，出現下嚥不暢等症狀。嚴重時可穿透主動脈層，導致大出血。食道潰瘍按照病理分型可分爲：淺表性潰瘍、深大性潰瘍。
3、食道狹窄
由胃食管反流引起的食道狹窄多發生於食道下段，病變可累及柱狀上皮、鱗狀上皮。
