藿香正氣水是不能用來治療腳氣的，這種藥物的作用是解表化溼、理氣和中，主要適用於內傷溼滯、夏傷暑溼或者是外感風寒所導致的感冒。而腳氣則需通過抗菌藥、角質剝脫劑、抗生素藥來進行治療。腳氣可以用抗菌藥來治療，常見的有米糠唑類、丙烯胺類等。腳氣也可以通過抗生素來治療，如伊曲康唑。伊曲康唑是口服類的藥物，主要適用於腳氣面積較大、外用治療效果欠佳、病情反覆的患者。
