藿香正氣水可以治療感冒，但治得最多的是暑溼感冒、風寒感冒以及熱傷風時導致的胃腸道反應，比如噁心、乾嘔，甚至拉肚子。
藿香正氣水的配方偏溫性，所以在感冒時一定要注意配伍藥物，雖然對胃腸道特別好，有和胃、降逆、止嘔的作用，同時藿香又有芳香解表的作用，但清熱力度確實不足，尤其在暑溼感冒時。雖然當時患者症狀以溼氣、困頓、頭重、噁心、不想吃飯等爲主，但畢竟還有暑氣存在，屬熱邪，因此可能很快會出現嗓子疼、嗓子幹，甚至咳嗽、有黃痰等症狀，所以在藿香正氣治療這一類型感冒時，一定要注意增加清熱的藥劑。
