一般來說，在患上巧克力囊腫這種疾病以後，患者不一定要接受手術治療，手術治療只是治療巧克力囊腫的方式之一，大家可以根據自己的病情來選擇自己可以接受的治療方式，常見的方式有藥物治療、穿刺抽液、腹腔鏡手術。
1、藥物治療：如果大家巧克力囊腫的病情較輕的話，那麼可以考慮採用藥物治療，藥物治療屬於保守的治療方式，比較建議囊腫直徑小於5釐米左右的患者使用，大家可以通過服用藥物使囊腫逐漸縮小直至消失。
2、穿刺抽液：如果說大家巧克力囊腫的病情較爲嚴重，但是又不願意進行手術治療的話，就可以考慮穿刺抽液療法，可以通過超聲波對於大家的囊腫進行穿刺抽液。在抽液以後還需要在其中注射入無水乙醇來有效的減少囊腫內液體的分泌，促進囊腫的閉合和黏連。
3、腹腔鏡手術：腹腔鏡手術是治療巧克力囊腫比較先進的一種治療方式，主要採取的是手術治療的方法，但是和傳統的手術治療不一樣的是，該手術辦法對患者身體的傷害比較小，可以幫助患者的卵巢保留其正常功能。
