咳嗽的耳朵疼痛應先確定是否應感染、炎症等因素所致，並針對炎症類型應用抗生素、滴耳液類藥物治療。
咳嗽導致耳朵疼痛，主要因咽喉部咽鼓管衝擊鼓膜導致，或因咳嗽過於嚴重，引起中耳炎症所致。應先去往醫院耳鼻喉科進行相關檢查，如血液學檢查、生化常規檢查等，必要時可進行胸部CT檢查，確定有無肺部疾病、感染的情況。
待明確炎症類型及具體程度，並應用頭孢類、紅黴素類抗生素消炎治療。嚴重性疼痛者需應用鹽酸洛美沙星滴耳液、氧氟沙星滴耳液、3%過氧化氫溶液等藥物緩解，一般治療7-10天左右，便可逐漸緩解。若疼痛持續嚴重，且伴有聽力下降、分泌物過度等症狀，需針對炎症類型予以手術治療。
