打完腦部疫苗發燒到39度，應該在醫生建議下吃退燒藥。人體的正常溫度在36度到37度左右，超過38.5度的話會出現高燒症狀，所以可以用酒精擦拭身體或者冷卻額頭來降低溫度。服用退燒藥後，如果有明顯的溫度下降傾向，可以先觀察，平時多喝水。但如果物理降溫的方法沒有用，就需要及時去醫院檢查，否則很容易造成大腦神經的損傷。
發燒後的治療
1、多喝熱水。發燒後可以先吃退燒藥，其次要多喝熱水，不要接觸冷水。否則，冷水刺激腸胃，加重病情。另外，多喝熱水也能加強身體的新陳代謝功能，有助於病情的恢復。
2、注射藥物。使用退燒藥也沒有效果的情況下，必須立即向醫院注射抗生素進行治療。身體內部發炎的情況下，容易出現發燒跡象，不易退燒，治療後也要檢查身體內部。
腦疫苗的作用
腦疫苗注射者主要對兒童，兒童免疫力差，外部細菌入侵容易成爲宿主。因此，注射流腦疫苗有效預防腦膜炎的出現，保持兒童腦功能的正常。
