手足口病常見的三種類型是柯薩奇病毒A型、柯薩奇病毒B型、腸道病毒71型手足口病。
1.柯薩奇病毒A型：感染兒童多見，成人感染佔百分之二十一。臨牀表現除上述外，主要特點爲急性發燒、皮疹。腦膜腦炎伴有Guillain-Barré綜合徵和急性病毒性心肌病。
2.柯薩奇病毒B型：感染引起特徵性傳染性胸肋痛(epide-micpleurodynia)即所謂Bornholm′s病。可合併腦膜腦炎、心肌炎、發燒、Guillain-Ba-rré綜合徵、肝炎、溶血性貧血和肺炎。
3.腸道病毒71型手足口病：發熱是腸道病毒71型手足口病的常見臨牀症狀，患者絕大多數是小於6個月嬰兒。急性呼吸道疾病是腸道病毒71型手足口病感染的又一常見臨牀症狀，它包括一些常見呼吸道症狀，如咽炎、哮喘、細支氣管炎和肺炎，發病年齡一般爲1～3歲，需要住院治療。
手足口病的臨牀表現變化多樣，病情輕重不一，一般表現爲陣攣、嘔吐、共濟失調、意向性震顫、眼球震顫及情感淡漠等。頭顱MRI及腦電圖檢查有助於明確疾病的嚴重性。
