中醫治療血吸蟲病根據疾病不同分期，治療方案有所不同。急性期患者主要由邪實過重所致，治療以驅邪爲主；而對於本虛標實體質，則以去邪扶正爲主。
1、急性期
處於急性發作期血吸蟲病，應以祛風解表、清熱利溼、行氣祛溼、活血化瘀、疏肝解鬱治療爲本，根據不同病情服用不同中藥改善具體病症。
2、慢性期
慢性期血吸蟲病是由於急性吸血蟲病轉化而來，病程持續週期較長，症狀較嚴重，中醫治療主要以辨證施治爲原則，根據不同病症，應用不同中藥予以服用。對肝腎陰虛症主要以涼血化痰爲主；而對於脾腎陽虛症則以溫補腎陽形體化水爲主；瘀血阻絡患者主要以行氣活絡爲主。
