非洲錐蟲病對患者具有非常惡劣的傷害，輕則引起疼痛、噁心嘔吐等症，重則使患者昏迷甚至死亡，所以做好預防非常重要。由於此病主要來源於寄生原蟲，所以從源頭上隔絕是非常有效的方法，平時應給家裏做好衛生清潔，注意殺蟲，外出時要做好防病蟲措施。
非洲錐蟲病臨牀上共分爲三個時期，第一爲侵入皮膚後引起不同程度的硬塊和結節，並演變成錐蟲性下疳，下疳發生於約三分之一的病人且出現的部位常爲皮膚外露被蟲蠅(tsetsefly)叮咬處，持續約3星期。第二爲血液淋巴時期，此時會有周期性發燒及寄生蟲血癥等症狀，包括倦怠、後頸部淋巴節腫、關節疼痛、頭痛及軀幹紅疹等情形發生，常見心肌炎，而因溶血及肝損傷之故也常見黃疸之出現。一旦侵入了腦部後，則會進入第三期腦膜腦炎時期，此時會有頭痛、失眠、動作失調及行爲障礙等情形發生，其他症狀包括全身乏力、胃口劇烈下降、身體消瘦等，嚴重者甚至會併發神智下降、昏迷甚至死亡。下面介紹一下錐蟲性“下疳”的預防方法：
1、流行地區居家環境及家畜噴灑殺蟲劑。
2、避免前往有大量采采蠅的地區；旅客如須前往，應儘量穿着長袖及長褲以覆蓋身體外露的部份，避免穿着會吸引采采蠅的藍色衣物。
3、家中加裝紗窗、紗門。
4、使用及睡在蚊帳內。
5、加強衛生教育宣導如何避免病媒蚊叮咬的重要性。
6、加強洗手。
7、病人住院期間，醫療工作人員應採標準防護措施，加掛蚊帳，碰觸血液、體液前後應用消毒劑洗手。
8、清除中間宿主采采蠅的棲身地，如河邊灌木叢。
9、做好檢疫，找出感染源加以撲滅。
