化學藥物治療宮外孕是一種新興的微創手術，治療方法是從大腿股動脈穿刺放入導管，通過導管找到異位妊娠的部位，然後注射小劑量的化療藥物，來達到手術所能達到的目的。一般採用全身用藥，亦可採用局部用藥。
適應證
化學藥物治療適用於早期宮外孕並且要求保存生育能力的年輕患者。符合下列條件，可採用化學藥物治療：
輸卵管妊娠包塊直徑<3cm；輸卵管妊娠未發生破裂或流產；無明顯內出血；血人絨毛膜促性腺激素(HCG)<2000U/L。
全身用藥
全身用藥常用甲氨蝶嶺(MTX)，治療機理是抑制滋養細胞增生，破壞絨毛，使胚胎組織壞死、脫落、吸收而免於手術。常用劑量爲0.4mg/kg·d，肌注，5日爲一療程。應用化學藥物治療，未必每例均獲成功，故應在治療期間應用B型超聲和HCG進行嚴密監護，並注意患者的病情變化及藥物的毒副反應。若用藥後14日，HCG下降並連續3次陰性，腹痛緩解或消失，陰道流血減少或停止者爲顯效。若病情無改善，甚至發生急性腹痛或輸卵管破裂症狀，則應立即進行手術治療。
局部用藥
局部用藥可採用在B型超聲引導下穿刺將藥物直接注入輸卵管的妊娠囊內，也可在腹腔鏡直視下穿刺輸卵管的妊娠囊，吸出部分囊液後，將藥注入其中，目前常用藥物仍爲MTX。
