連花清瘟膠囊和顆粒主要的區別在於劑型不同。
連花清瘟膠囊和顆粒劑的主要成分，以及藥物的療效和功能沒有很大差異，但外觀差異較大，使用範圍也不同。連花清瘟膠囊一般適合成人服用。通常攜帶方便。對於吞嚥功能差或配合不良的兒童，可以使用連花清瘟顆粒治療。連花清瘟顆粒在水中溶解後更容易被兒童接受。一般來說，連花清瘟膠囊或連花清瘟顆粒可以清除毒素併發燒。對某些流感引起的發熱、肌肉疼痛、鼻塞、流鼻涕或咳嗽有一定的療效。連花清瘟膠囊和顆粒本質上是同一個藥物，只是藥物的劑型不同，二者的功效也是完全一致的。在臨牀當中連花清瘟膠囊和連花清瘟顆粒都可以用來治療流行性感冒，可以促進病情恢復。但是嚴重的流行性感冒，通常需要配合奧司他韋等神經氨酸酶抑制劑進行治療。此外使用連花清瘟膠囊或者連花清瘟顆粒的時候，應該在中醫辨證施治的情況下用藥。
