沒有治療皰疹的最佳方法，患者需根據自身病情在醫生指導下進行治療，常見的治療方法有系統藥物治療和外用藥物治療。
早期給予患者卡馬西平片或消炎痛，可緩解疼痛的症狀，需進行週期性用藥，會取得較好效果。對症狀嚴重者，可口服注阿昔洛韋、泛西洛韋、萬乃洛韋等抗病毒藥物。還可注射丙種球蛋白或正常人白細胞轉移因子，使用干擾素進行治療。
目的是吸收乾燥、抗病毒、防止繼發感染，可在患病部位塗抹硫磺爐甘石洗劑、酞丁胺軟膏、2%龍膽紫液、3%阿昔洛韋軟膏、1%代馬妥軟膏、0.5%新黴素軟膏等。如滲出較多時，最好選用3%硼酸液或3%醋酸鋁溶液溼敷。出現繼發感染時，使用夫西地酸乳膏、莫匹羅星軟膏。患者的用藥需要嚴格遵照醫囑，不能擅自用藥。
