一旦發現子宮囊腫，應儘早確定其爲腫瘤性的囊腫還是非腫瘤性的囊腫。可依據腫瘤生長的快慢、大小、性狀，以及相應的檢查，如：子宮輸卵管造影、靜脈腎盂造影、超聲診斷或腹部斷層掃描、核磁共振，乃至腹腔鏡檢查、剖腹探查，可以明確診斷，如果是腫瘤性的囊腫，不管是否懷疑爲惡性均要早期手術切除。
1.組織活檢檢查
如果陰道鏡檢查有疑問，則醫生會在陰道鏡定位下，對可疑病變處取少許宮頸組織行活檢檢查，醫生通過這些檢查方法，即可判斷宮頸有沒有病、有什麼病，並給出相應的治療措施。
2.細胞學檢查
醫生會詢問就診者症狀及月經情況，並進行婦科檢查，肉眼觀察宮頸的情況，包括有沒有宮頸糜爛、贅生物等，最常用的是巴氏塗片法，巴氏3級是可疑癌、巴氏4級是高度可疑癌、巴氏5級是癌症。
3.陰道鏡檢查
如果細胞學結果有異常，醫生還建議做陰道鏡檢查，陰道鏡可把宮頸表面放大若干倍。在宮頸表面塗上百分之三醋酸溶液後，因爲有病變的地方，上皮會呈現不同程度的白色。
