大多數前列腺炎都屬於非細菌性的前列腺炎，在臨牀上非細菌性前列腺炎佔總數的80%，這種前列腺炎的治療方法比細菌性的複雜且比較易復發，根據致病因素不同及臨牀症狀不同治療方法也不同。
Ⅲ型慢性非細菌性前列腺炎
Ⅲ型前列腺炎可按照有無尿道症狀及白細胞數量分爲ⅢA型和ⅢB型前列腺炎，這兩種前列腺炎的治療方法也是不同的。
ⅢA型由於病原體診斷不確定性，以及有可能存在某些難培養的病原體，所以在病原體確定之前至少要用一個療程的廣譜抗生素治療，可以採用連續或序貫法給藥，當這些抗生素應用無效時，就沒有必要進行進一步的抗生素治療了。α-AR阻滯劑應用是普遍而有益處的，抗炎藥物的治療可以緩解炎性疼痛，保列治則適用於合併前列腺增生的患者，戊聚糖多硫酸鹽及其他植物藥療法可以改善恥骨上疼痛和排尿異常，前列腺按摩可以緩解1/3患者的症狀，最後可以考慮經尿道熱療。
ⅢB型主要治療目的在於如何改善患者症狀，可以採用序貫或聯合應用α-AR阻滯劑、止痛藥、肌肉鬆弛劑、前列腺按摩和其他支持療法，同時進行飲食和生活習慣的改善。
Ⅳ型無症狀性前列腺炎
這種類型前列腺炎無任何臨牀症狀，多在體檢中或其他疾病診察中發現，一般不需要治療，只有在患者合併前列腺癌、前列腺增生或其他合併症時才考慮相應的治療措施。
