包皮過長對男性身體存在着不良影響和傷害，及早治療可以將這些危害威脅降到最低。
對於青少年朋友來說，青春期後，陰莖海綿體開始膨脹，陰莖逐漸發育變大，但若患有包莖、包皮過長，就會對陰莖海綿體造成一定的束縛，阻礙陰莖的發育，造成陰莖短小或(和)小龜頭症。
包皮龜頭炎在包皮過長患者中常見。其原因是包莖或包皮過長的包皮腔內，常有大量的包皮垢，而包皮垢是細菌和各種致病微生物的良好培養基，可能誘發包皮龜頭炎，並向上逆行，形成尿道炎、膀胱炎、腎盂腎炎，甚至前列腺炎、輸精管炎、附睾炎、睾丸炎。若有不潔性生活史，則感染性病的可能性比正常人要大很多。
包皮過長對男性正常的性功能和生育能力也有一定影響。由於包莖、包皮過長患者的包皮腔內，均有不同程度的炎症，會使龜頭過於敏感，從而易發生早泄或者遺精，嚴重者可導致陽痿。另外細菌還可以影響精子活力，故可導致男性不育症。
有些患者經常拖延包皮過長的治療，但是要注意如果包皮過長不及早進行治療，可能會誘發陰莖癌。因爲包莖、包皮過長患者包皮腔中的包皮垢長期刺激，易誘發陰莖乳頭狀瘤和癌症的發生。
包皮過長越早治療越好，但是對於剛出生的嬰兒，這個時候出現包皮過長是正常的生理現象，不必急着採取積極的治療措施。在平時注意多觀察，並用手讓包皮進行再次發育。
