甲真菌感染引起的指(趾)甲病在皮膚癬菌病中約佔30%，而手足癬患者中約50%伴有灰指甲，患病率隨年齡的增長而增高。根據真菌侵犯甲的部位和程度不同，可分爲白色淺表型、遠端側位甲下型、近端甲下型、全甲毀損型、甲板內型及黑色甲下甲真菌病等。
(1)白色淺表型：90%以上由須癬毛癬菌所致，也可由真菌如黑麴黴、尖孢鐮刀菌、枝頂孢等引起。兒童可能由感染白色念珠菌所致。致病菌直接侵犯甲板表層，初起時爲小於1 mm的白色島嶼狀，逐漸擴大成白色雲霧狀混濁，甲板表面凸凹不平或變形。
(2)近端甲下型：通常由念珠菌屬引起，病變起於甲板近端，初爲小白點，逐漸擴大可侵及整個甲板。多通過甲小皮而進入甲板或甲牀。表現爲甲半月和甲根部粗糙肥厚、凹凸不平或破損。
(3)遠端側位甲下型：爲最常見的一種，在患甲下碎屑內能找到菌絲，可培養出皮膚癬菌。多由手足癬蔓延而來。真菌從一側甲廓逐漸累及甲的遠端前緣及側緣並使之增厚、灰黃渾濁，甲板表面凸凹不平或破損。
(4)甲板內型：是真菌感染指(趾)甲的一種新的類型，真菌穿過甲角質層，形成奶白色斑片，無甲下角化過度或甲分離。還有真菌菌絲在甲內形成團塊，稱爲皮膚癬菌瘤，多由蘇丹毛癬菌和紫色毛癬菌引起。
(5)全甲毀損型：是各型甲真菌病發展的最終結果。表現爲整個甲板被破壞，呈灰黃色、灰褐色，甲板部分或全部脫落，甲板表面殘留粗糙角化堆積物，真菌侵入整個甲板，甲結構完全喪失，甲母質和甲牀呈乳頭瘤樣改變，其上覆蓋不規則角化團塊。甲牀亦可增厚、脫屑。
