黏液大便可能是細菌性痢疾、潰瘍性結腸炎、克羅恩病等疾病引起的，需針對病因合理用藥治療。
感染志賀菌引起細菌性痢疾時，腸粘膜充血、水腫，常有腹痛、腹瀉、裏急後重、排黏液膿血便等症狀。確診後可用左氧氟沙星片、鹽酸環丙沙星片、枯草桿菌二聯活菌膠囊等藥物抗菌消炎，調整腸道菌羣，緩解病情。
經常吃高油、高脂、高糖食物，免疫功能紊亂，導致病菌入侵，使腸道粘膜分泌異常時，可能出現潰瘍性結腸炎。患者腸道粘膜潰瘍，常有腹瀉、腹痛、黏液血便、發燒、身體消瘦等表現。常用地塞米松磷酸鈉注射液、複方倍他米鬆注射液、美沙拉秦緩釋顆粒劑等藥物抗炎，促使潰瘍儘快癒合。
免疫功能紊亂、感染等還可能引起克洛恩病，患者腸壁有增殖性病變，導致腸道功能紊亂，有腹痛、腹瀉、黏液性血便等表現。可用諾氟沙星膠囊、甲硝唑片、曲安奈德注射液等藥物抗炎，使病情儘快好轉。具體用藥需遵醫囑，不可盲目用藥。
