HPV治療後值變高了，是因爲深層的病毒暴露後所致，是治療過程中的常見現象。
HPV病毒主要存在於表皮和黏膜上皮，有一部分病毒存在於表層，還有一部分存在於深層。在進行抗病毒治療時，通常需要從表面開始，也就是說要將表面的病毒清除。由於深層隱藏着大量的病毒，經過一段時間的治療後，表面的病毒被清除乾淨，但是深層的病毒卻暴露出來，若在這種情況下進行檢測，會發現病毒定量值增高。
沒有開始治療之前，位於皮膚和黏膜表面的HPV病毒量較少，所以病毒定量值不是很高，因爲這個時候深層次的病毒還沒有暴露。隨着治療的深入，深層的病毒暴露出來，檢查數值也會升高。這種情況並不是因爲治療無效或病情加重所致，而是病情好轉的跡象，無需過多擔心，只要持續治療即可。
