肛門周圍皮下膿腫最常見，多由肛腺感染經外括約肌皮下部向外或直接向外擴散而成。對於各種不同類型的肛周膿腫，其治療原則通常是一致的，即最主要的就是及時切開排膿，並做到引流通暢，以及全程的抗炎治療措施。得了肛周膿腫應該如何治療呢？
在治療肛周膿腫的時候，一般認爲要注意以下幾點。
（1）切口要準確，必要時可先行穿刺抽膿，選好切口部位再切開。
（2）淺部膿腫切口呈放射狀，直達膿腔，並擠壓膿腔周圍使膿液儘可能排完。深部膿腫應做直切口，避免損傷括約肌，切開後以止血鉗或蝶型探針做鈍性分離，達膿腔，並使膿液排盡。
（3）引流要徹底，膿腫切開後應以手指探查膿腔，尤其是馬蹄形膿腫，應分開膿腔中的纖維間隔，以利引流。對肛門周圍皮下膿腫，引流物可選擇凡士林紗條或橡膠片，而對深部膿腫的引流則必須使用橡皮管或捲菸引流條。
（4）抗炎藥物的選擇很大程度上影響着治療的成敗。對肛周膿腫的急性感染期和手術後初期，抗生素的使用要足量、全程，可使用廣譜抗生素，或青黴素、甲硝唑、慶大黴素等聯合使用。
（5）術中應以探針探取原發感染性內口，必要時可用亞甲藍來顯示內口的所在，切開原發性的肛竇內口，常常可預防肛瘻的形成，以達到肛周膿腫的一期手術治療效果。
