目前對於癲癇的治療主要以藥物治療爲主，但是經過正規抗癲癇藥物治療，仍有約20%～30%患者爲藥物難治性癲癇，外科手術治療爲這部分患者提供新的治療手段，然而並不是所有的癲癇病人都適合手術治療的。
1、進行性加重：癲癇發作是否會進行性加重，目前仍有爭議，癲癇病的進行性加重表示有繼發性癲癇竈的產生或病變的神經元增多，使得癲癇發作程度加重，藥物和手術治療效果降低。在動物模型中已觀察到隨着癲癇病程的延續有繼發性癲癇竈的產生和更多的神經元參與放電，這是適合癲癇病手術治療的。
2、對兒童生長髮育的影響：在新生兒和幼兒，長期的癲癇發作較易對正常的腦發育產生負性作用。由於新生兒和幼兒處於腦可塑的關鍵階段，癲癇病竈外的正常腦組織的發育依賴感覺傳導通路和鄰近的腦皮質的生理信號的刺激，而來源於癲癇病竈的異常放電則形成異常的電化學環境造成皮質在突觸、細胞膜水平的永久性異常發育。
3、頑固性癲癇患者：經抗癲癇藥物的系統治療後，癲癇仍頻繁發作的病例應考慮手術。對於癲癇發作的頻率並無明確規定，一般認爲多於一次/月。對於發作只有數次/年的病例，需要數年的時間判斷治療是否有效，不然手術的價值就不易評估了，當治療藥物濃度已給病人帶來嚴重的毒副作用時，應考慮手術治療。
4、癲癇對患者的日常功能造成影響：目前普遍認爲，只有當癲癇影響病人的日常生活時才考慮手術治療，若癲癇僅在夜間發作，則不會對病人日常生活產生大的影響。
手術治療癲癇雖然徹底但是仍有復發的可能性，而且手術存在一定的風險，因此，應根據癲癇手術治療的適應症，慎重選擇。
