衆所周知，男科疾病包括前列腺疾病、男性不育症、性功能障礙、性傳播疾病等。療程是醫生基於對疾病病理生理的認識，結合藥物理論，進而總結的治療規律。但是，療程要因病因人因時而異，提倡治療一定要有句號，不可無限期的治療。
一、因病而異
1、無精症：若男性不育症患者已被診斷爲生精功能障礙類似於判處“死刑”。很多患者對中醫藥的神奇療效抱有幻想。建議此類患者，中醫藥的確有時收到意想不到的效果，但是，不可誇大療效。對於經睾丸活檢已經明確生精功能障礙的患者，不建議患者無限期的長期治療，適可而止。
2、早泄：臨證之時，經常採用中西醫結合治療早泄，西藥經常採用帕羅西汀治療，早泄患者在治療過程中，要注意調整心態、鍛鍊身體、積累性生活技巧、培養夫妻感情，不可長期依靠帕羅西汀延長性生活時間。
二、因人而異
男科疾病伴有焦慮患者，經一段時間治療，前列腺炎、勃起功能障礙患者都能緩解或痊癒，但是患者由於長時間的疾病引起焦慮，導致沒有信心相信自己已經是健康人，總懷疑自己還是不行，擔心疾病復發，不敢停止治療。郭軍主任建議患者，治療後，患者一定要自信的面對生活，採用鍛鍊身體、飲食調養等養生方法保持青春活力、健康身體，患者一定要打開心結。
三、因時而異
臨牀上我們經常強調“男人就像車，一定要適時保養”。很多疾病的發病具有時間規律。或是某時加重，或是某時減輕。所以在疾病發病之前，就要開始積極的治療，以防發生。但是不可長期治療，度過這一階段，就要停止治療，以防傷害人體正氣。例如：男科患者的病機常常是溼熱下注。
夏秋之交，自然界溼氣很重，此時患者可以預防性治療，但是，度過這一時期，患者就不必再治療。腎虛的患者，一般在冬日選擇補腎，藉助冬氣，補腎效果顯著。春天來的時候，就該結束補腎。
治療的終極目標：治療後期，越來越減少藥物的干預，增加患者的主動性，通過鍛鍊、飲食等養生方法，達到健康。
