藥物流產本身對再次妊娠造成的影響很小，但發生併發症時，對再次妊娠就會造成一些不利的影響。
不孕
藥物流產感染治療後的病人，沒有采取避孕措施而1~2年以上不孕者，應該考慮是否由於藥物流產造成輸卵管炎症黏連、堵塞，導致繼發不孕。應及時進行輸卵管通液術或造影術，早診斷、早治療。
前置胎盤的發生率增加
藥物流產後陰道流血時間長則會導致子宮內膜炎或子宮損傷，使子宮蜕膜血管生長不全。再次懷孕時，當受精卵植入時，血液供應不足，為了攝取足夠的營養而胎盤面積擴大，伸展到子宮下段，造成前置胎盤。前置胎盤是發生妊娠晚期出血的主要原因之一。
胎盤黏連和植入性胎盤的發生率增高
藥物流產後發生子宮內膜炎，再次懷孕後可引起胎盤全部或部分黏連。由於子宮內膜炎、蜕膜發育不良、營養供應不足，使胎盤向子宮胎層植入，以吸取更多的營養。胎盤黏連和胎盤植入都是造成產後出血的原因之一。
