臨牀上，兒童癲癇很容易被誤診爲其他疾病而耽誤了治療，很多患兒家長在擔憂孩子病情的同時，也很疑惑其中的緣由。
衆所周知，診斷癲癇症的金標準不是哪一個指標，而是一份詳盡的關於診斷之前、期間、之後所發生的病情目擊報告。一份細心的病史通常是用來區別與其他瞬時神經幹擾症狀所必需的。當缺少這份報告時，做癲癇診斷是很困難的。
對於一些年齡較小的孩子來說，他們並不樂意或很難清楚解釋他們所經歷的感受。同時，小孩子伴隨出現的其他狀況，如偶然的異常行爲或知覺，都可能成爲誤診癲癇的診斷理由，因爲他們的臨牀徵兆並不像較大的孩子一樣清晰明瞭。因此，對於那些還未上學或者行爲上還沒有形成條理的孩子來說，準確的診斷需要擁有專業知識的人才能做出。
可能患兒家長還會存在這樣的疑問，通過腦電圖不就可以最終確定孩子是否患有癲癇了嗎？而事實上，只有當一個孩子達到12～14歲時，他的腦電圖才形成一個正常的成年人圖形。在此之前，某些看似異常的波長和模式都可能是一個孩子大腦成熟的正常部分。但是，許多神經生理學家對於分析兒童腦電圖的經驗是有限的，很多正常的、成熟的模式因此被解釋爲超出了正常的界線，於是困惑的兒科醫生們就會被不適當的腦電圖解釋所誤導，並錯誤地做出癲癇的診斷。
