新生兒房間隔缺損如果只是單純性狀態，一般情況下不用特殊的進行治療，會慢慢的自然癒合。如果缺損口小於0.5釐米內，都有癒合的可能，家長要注意如果在新生兒一歲後還沒有癒合，就要採用手術方法進行治療，可以通過手術或者介入的方法根治，在手術後家長也要及時的做好護理與複查。
現代醫學科技不斷在進步發展，再加上育齡女性備孕時都會去做孕前檢查，因此先天性畸形兒出生的數量逐漸減少，得到有效的控制，但仍有少部分新生兒可能在胚胎髮育時期受到某些因素的影響，出現發育畸形的情況，那麼新生兒心臟房間隔缺損怎麼辦？
新生兒如果檢查發現有先天性心臟病，就要做進一步檢查確認，如果只是患上單純性房間隔缺損病症，在特定情況下有可能會自然癒合的，如缺損口小於0.3釐米基本上是能夠自愈的，小於0.5釐米裏面有很大的可能性自愈，但如果一歲後沒有自愈的，就必須採取治療了。
如果單純性房間隔缺損的缺損口大於0.5釐米，或者是兩個缺損病症合併在一起，即房損與室缺合併，這兩種症狀基本上是沒有自然癒合的可能性，只能通過手術或者介入的方法根治，而且應儘量在患兒小的時候就進行治療，避免對日後生活產生不良後果。
手術與介入兩種治療方法，一般都是以手術治療爲第一治療方法，只有不適合手術治療的患兒，才改爲使用介入治療，由於房間隔缺損疾病在嬰幼兒時間是沒有明顯症狀的，所以家長應多觀察新生兒身體狀況，並且做好新生兒兒保檢查，以便能儘早發現病情給予措施處理。
在術後應當進行強心或者是利尿治療，術後患兒的衛生方面也要格外注意，小寶寶的衣物應當經常的更換及清洗，給患兒創造較爲安靜的居室環境，讓寶寶多喝一些水，另外還要避免感冒的發生，以免影響到患兒的病情恢復，帶來不利的影響。另外在術後的3-6個月進行門診複查。
