前列腺炎是男性生殖系統的常見病，由於急性前列腺炎有較明確的臨牀特點，故目前對它的診斷相對容易。相反的，慢性細菌性前列腺、非細菌性前列腺炎和前列腺痛在臨牀上難以區分。
症狀體徵無法鑑別
由於慢性前列腺炎的臨牀特點非常不確定而且變異很大，慢性細菌性前列腺、非細菌性前列腺炎和前列腺痛許多症狀和體徵常無法鑑別，導致在臨牀上較難區分。
病理組織學表現不特異
前列腺的病理組織學檢查只能診斷特殊類型的前列腺炎，如肉芽腫性前列腺炎。依靠慢性細菌性前列腺炎的組織學變化並不能明確引起炎症的病原體的特異性。很多研究表明各類型的慢性前列腺炎綜合徵的病理組織學變化無差異，沒有鑑別的意義。
此外，無論病原體檢查是陽性還是陰性，所有標本均存在不同程度的局竈性慢性前列腺炎病理組織學變化，而且臨牀檢查的病原體並不引起特異性病理組織學變化，這也進一步證實了病理組織學檢查不能鑑別慢性前列腺炎綜合徵的類型。
輔助檢查不能確診
同樣放射影像學檢查、尿道膀胱鏡等檢查有助於鑑別診斷和明確併發因素，但均不能依靠它們確診前列腺炎。因此，臨牀擬診前列腺炎並不困難，但要明確病因和病原體絕非易事。
