新生儿先天性心脏病能否自愈，与疾病的类型、病情轻重等因素有关，不能一概而论。
新生儿先天性心脏病是胚胎期心脏及大血管发育异常引起的疾病，包括卵圆孔未闭、动脉导管未闭、房间隔缺损、室间隔缺损、法洛四联症、艾森曼格综合症等多种类型。部分先天性心脏病无需治疗，可随着年龄增长自愈。如卵圆孔未闭、动脉导管未闭、轻微的房间隔缺损和室间隔缺损等先天性心脏病，通常会在一周岁之内自愈。所以出现这些先天性心脏病时，一般不主张马上就做修复手术，注意观察，一周岁后不能自愈再做手术修复。
如房间隔缺损、室间隔缺损患儿的缺损面积较大，不可盲目等待自愈，需手术修复，一般预后效果较好。如为法洛氏四联症、艾森曼格综合症，病情严重，更无法自愈，前者需尽早安排手术治疗，后者需长期持续用药，稳定病情。
