儿童流清鼻涕最有效的治疗方法即是对因治疗，如是因上呼吸道感染所致，可服用抗感冒药物，并配合中医按摩缓解症状；因鼻炎所致，需明确鼻炎类型对症用药，并远离过敏源。
如儿童流清鼻涕的症状持续3-5天，考虑是外感风寒或是病毒感染引起的上呼吸道感染，可以给予小儿感冒颗粒、小儿氨酚黄那敏颗粒、对乙酰氨基酚口服溶液等药物治疗。如流涕情况严重，可用温热纱布湿敷鼻梁，促进局部血液循环，以缓解症状。或点揉按摩开天门、迎香穴等穴位，以缓解鼻塞流涕等症状。
若儿童流涕持续时间较长，超过10天以上，甚至1个月，即可能是过敏性鼻炎所致，此时需要口服抗过敏药物，如氯雷他定片、盐酸西替利嗪口服溶液，并配合内拿舒等鼻喷剂，以消除过敏症状。日常也需远离花粉、动物毛发、螨虫等过敏源，坚持早晚用海盐水进行鼻腔护理，也能提高鼻腔抗病能力。
